موسسه امام صدر تشکلی غیردولتی و غیر انتفاعی است که با تکیه بر منظومه فکری و عملی امام موسی صدر، به میثاق اخلاقی زیر پایبند است:
ایمان حقیقی به خداوند به عنوان اساس و ضمانِ تمام فعالیت‌های خود؛
ایمان به انسان و کرامت و آزادی او که جنبه زمینی ایمان به خداوند است؛
ایمان به آموزه‌های اسلام و دین به عنوان راه نجات و آرامش و تعالی انسان معاصر؛
اعتقاد به عدالت آفریدگار و لزوم استقرار عدالت در زندگی فردی و اجتماعی انسان؛
اعتقاد به استحقاق انسان برای تعالی، آرامش و برخورداری از امکانات مادی و معنوی؛
اعتقاد به ظرفیت اسلام برای پاسخگویی به نیازهای جامعه انسانی و حل مشکلات جهان؛
اعتقاد به وظیفه انسان در صیانت از عناصر هستی و تعامل منسجم و هماهنگ او با کاروان هستی؛
اعتقاد به ضرورت تفاهم و تعامل میان پیروان ادیان الهی براساس اصل ” کلمه سواء”؛
اعتقاد به گفت‌وگو به عنوان راهکاری ضروری برای درک متقابل و مآلا توسعه تفاهم اجتماعی و کاهش بحران‌های جامعه بشری.

در این پیوند موسسه در سال 1382 تحت شماره 15788 تأسیس شده و تمام فعالیت‌های آن برای تحقق دو هدف اصلی «پیگیری قضیه ربودن امام موسی صدر و نجات ایشان» و «معرفی منظومه فکری و مجموعه اقدامات عملی امام» طراحی و اجرا شده است. همچنین مؤسسه در سال 1387 پروانه نشر خود را به شماره 8520 از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی گرفته است.