محمدرضا خلیلی درسال 1337 در روستای کلاریجان در خانواده‌ای مذهبی به دنیا آمد و دوران طفولیت را در کانون گرم خانواده پشت سرگذاشت.
محمدرضا تحصیلات ابتدایی را در زادگاهش و دوره راهنمایی و دبیرستان را درزیراب و قائمشهر گذراند و پس از اخذ دیپلم وارد دانشگاه تربیت معلم تهران شد.
تحصیلات او که با سالهای آغازین انقلاب همگام گردیده بود باعث شد تا در تظاهرات مردمی و افشاگران شرکت نماید بطوری‌که فعالیت‌هایش مقابل رژیم منحوس پهلوی موجب دستگیری او توسط ساواک گردید که پس از مدتی آزاد شد.
بعداز پیروزی انقلاب به تبلیغ و تبشیر اسلام و رساندن پیام امام خمینی به مردم
منطقه پرداخت و مبارزه با گروهک ضدانقلاب را در پیش گرفت.
محمدر‌ رضا در تشکیل انجمن اسلامی در روستای کلاریجان و کتابخانه اقدام نمود و با این کار حاکمیت حزب‌الله را در روستایش به تثبیت رسانید.
بعد از شروع جنگ تحمیلی خود را به سپاه پاسداران معرفی نموده و با طی آموزش نظامی با گروه شهید چمران به جبهه‌های سوسنگرد اعزام شد و بعد از مجروحیت به وطن بازگشت و بار دیگر در عملیات فتح‌المبین شرکت کرد.
پس از آزادسازی شهر سوسنگرد در مرحله دوم عملیات در تاریخ 1361/2/18 به شهادت نائل آمد و دفتر دانشجوی شهیدمان بسته شد.